Les boites de pétri sont composées de deux cercles en verre de 12cm de diamètre environ avec un rebord de 1cm de haut. Le cercle le plus large (plus large de quelques millimètres) est posé à l'envers sur le plus petit, formant ainsi un couvercle qui est simplement posé, et non vissé.
L'avantage c'est qu'elles sont en verre, donc faciles à laver et désinfecter en autoclave (cocotte-minute, si on veut). Mais l'important c'est que le couvercle doit seulement être posé, ni scellé ni vissé. Ou alors il doit être légèrement poreux (mais pas trop, attention à la taille des trous, Craonne, quelques coups d'épingle suffiront amplement).
L'autre point important est le choix du support "de culture" : il doit limiter la prolifération de champignons et bactéries en étant aussi stérile que possible et aussi stable. C'est pourquoi le buvard est apprécié : il peut être mouillé et séché autant de fois que l'on veut sans s'abimer, et les racines ne s'enfoncent pas dedans comme cela arrive avec le papier essuie-tout (ce dernier peut en outre être traité avec des désinfectants, donc vigilance là aussi).
Lorsque l'on est à peu près certains de vouloir récupérer les plantules on utilise parfois de la vermiculite fine à la place du buvard. De cette façon les racines peuvent se développer dans un milieu moins "agressif" (sècheresse relative, lumière, etc.), sans pour autant s'emmêler dans du papier. Au pire un ou deux grains restent collés et sont repiqués avec la graine