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La fonte des semis n'est pas une maladie mais un terme générique pour désigner un ensemble de maladies affectant les plantules nouvellement germées et causées par plusieurs sortes de micro-organismes présents dans le sol: Pythium et Rhizoctonia solani, le plus souvent, mais aussi Fusarium, Thielaviopsis basicola,  quelques Phytophthoras du sol (racines et collet), Botrytis, Sclerotinia, et d’autres.
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La fonte des semis n'est pas une maladie mais un terme générique pour désigner un ensemble de maladies affectant les plantules nouvellement germées, et causées par plusieurs sortes de micro-organismes présents dans le sol: Pythium et Rhizoctonia solani, le plus souvent, mais aussi Fusarium, Thielaviopsis basicola,  quelques Phytophthoras du sol (racines et collet), Botrytis, Sclerotinia, et d’autres.
  
Les pathogènes sont variés et les symptômes le sont aussi. Mais le résultat est le même : les jeunes plantules  s’affaissent et meurent, les semis disparaissent.  
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Les pathogènes sont variés, les symptômes aussi. Mais le résultat est le même : les jeunes plantules  s’affaissent et meurent, les semis disparaissent.  
  
  
Des pousses à des stades plus ou moins avancés de leur développement peuvent soudain se plier en deux et dépérir rapidement. La tige le plus souvent se dessèche et s’affaisse, mais peut aussi se désintégrer brutalement. Le point de rupture se situe plus ou moins au niveau du sol.
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Des pousses, à des stades plus ou moins avancés de leur développement, peuvent soudain se plier en deux et dépérir rapidement. La tige le plus souvent se dessèche et s’affaisse, mais peut aussi se désintégrer brutalement. Le point de rupture se situe plus ou moins au niveau du sol.
  
 
Quelquefois les germes n’émergent même pas, les graines se ramollissent et pourrissent.
 
Quelquefois les germes n’émergent même pas, les graines se ramollissent et pourrissent.
  
Avec les infections par pythium tiges et racines noircissent et pourrissent. Dans le cas de rhizoctonia solani les lésions peuvent être brun rouge. Thielaviopsis basicola et phytophthora nicotianiae  attaquent les racines qui noircissent et pourrissent.
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Avec les infections par pythium, tiges et racines noircissent et pourrissent. Dans le cas de rhizoctonia solani, les lésions peuvent être brun rouge. Thielaviopsis basicola et phytophthora nicotianiae  attaquent les racines qui noircissent et pourrissent.
  
  
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*Utiliser un terreau pauvre en azote pour les semis, et attendre que les plantules aient atteint le stade trois vraies feuilles avant d’apporter une fertilisation.
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*Utiliser un terreau pauvre en azote pour les semis, et attendre que les plantules aient atteint le stade de trois vraies feuilles avant d’apporter une fertilisation.
  
  
*Dans le cas qui nous intéresse (semis en terrine à 24°) la stérilisation du terreau de semis est le meilleur moyen d’éviter le problème. Un passage au four à 80/90° pendant une demi-heure, ou  5 à 10 minutes au micro-ondes permettent de détruire les spores. (Mais attention, une nouvelle contamination en milieu stérile permettrait une prolifération du pathogène, dont le développement est bloqué par la concurrence de micro-organismes antagonistes et inoffensifs normalement présents dans un substrat sain).  
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*Dans le cas qui nous intéresse (semis en terrine à 24°), la stérilisation du terreau de semis est le meilleur moyen d’éviter le problème. Un passage au four à 80/90° pendant une demi-heure, ou  5 à 10 minutes au micro-ondes, permettent de détruire les spores. (Mais attention, une nouvelle contamination en milieu stérile permettrait une prolifération du pathogène, dont le développement est bloqué par la concurrence de micro-organismes antagonistes et inoffensifs normalement présents dans un substrat sain).  
  
  

Version du 10 juillet 2015 à 08:32

La connaitre

Fonte des semis sur une plantule de pin taeda


La fonte des semis n'est pas une maladie mais un terme générique pour désigner un ensemble de maladies affectant les plantules nouvellement germées, et causées par plusieurs sortes de micro-organismes présents dans le sol: Pythium et Rhizoctonia solani, le plus souvent, mais aussi Fusarium, Thielaviopsis basicola, quelques Phytophthoras du sol (racines et collet), Botrytis, Sclerotinia, et d’autres.

Les pathogènes sont variés, les symptômes aussi. Mais le résultat est le même : les jeunes plantules s’affaissent et meurent, les semis disparaissent.


Des pousses, à des stades plus ou moins avancés de leur développement, peuvent soudain se plier en deux et dépérir rapidement. La tige le plus souvent se dessèche et s’affaisse, mais peut aussi se désintégrer brutalement. Le point de rupture se situe plus ou moins au niveau du sol.

Quelquefois les germes n’émergent même pas, les graines se ramollissent et pourrissent.

Avec les infections par pythium, tiges et racines noircissent et pourrissent. Dans le cas de rhizoctonia solani, les lésions peuvent être brun rouge. Thielaviopsis basicola et phytophthora nicotianiae attaquent les racines qui noircissent et pourrissent.


Tous ces micro-organismes sont présents dans le sol sous forme de spores qui germent et attaquent les plantules dès qu’ils trouvent des conditions favorables.

Le phénomène se produit surtout en sol froid et compact. Mais certains pathogènes préfèrent la chaleur. Tous ont comme point commun de se développer en milieu très humide.



Prévention

  • Il faut utiliser un terreau léger, éviter un excès d’humidité, assurer un bon drainage, et favoriser une germination très rapide en évitant de trop enterrer les semences. Laisser le terreau s’assécher légèrement avant chaque nouvel arrosage.


  • Utiliser un terreau pauvre en azote pour les semis, et attendre que les plantules aient atteint le stade de trois vraies feuilles avant d’apporter une fertilisation.


  • Dans le cas qui nous intéresse (semis en terrine à 24°), la stérilisation du terreau de semis est le meilleur moyen d’éviter le problème. Un passage au four à 80/90° pendant une demi-heure, ou 5 à 10 minutes au micro-ondes, permettent de détruire les spores. (Mais attention, une nouvelle contamination en milieu stérile permettrait une prolifération du pathogène, dont le développement est bloqué par la concurrence de micro-organismes antagonistes et inoffensifs normalement présents dans un substrat sain).


  • Stériliser terrines, godets et matériel de semis.


  • Du charbon en poudre pulvérisé sur la surface de la terrine ou mélangé aux premiers centimètres de terreau permet aussi d’éviter de perdre ses semis, ou de récupérer des plantules qui ont souffert d’un arrosage excessif et commencent à dépérir (personnellement j’utilise du charbon actif pour filtres d’aquarium réduit en poudre fine.)


  • Certains de ces pathogènes peuvent être présents sur ou dans les semences, voir : « Désinfection des graines », « Transmission des maladies par les graines ».


  • Sur Tomodori, un exemple d'utilisation de l'iode contre la fonte des semis:
http://tomodori.com/forum/post193959.html#p193959


Macération d’ail, décoction de prêle, infusion de camomille, extraits de raifort ou de patience (rumex à feuilles obtuses)

un site américain conseille comme fongicides faits-maison en prévention de cette fonte des semis :
- Une forte infusion de camomille ou de cannelle, pour arroser ou pulvériser semis et plantules.
- Un brouillard d’eau additionnée d’eau oxygénée à 3% en brumisation.
- Ils conseillent de poudrer la surface du semis avec de la cannelle (cette méthode, que j’ai expérimentée, a donné chez moi des résultats inférieurs au poudrage de charbon.)

Source : http://gardening.about.com/od/gardenproblems/qt/Damping-Off.htm


On conseille également la macération d'orties ou l'infusion de clou de girofle.



Sources et lectures supplémentaires :

http://eap.mcgill.ca/agrobio/ab360-07.htm

http://tomclothier.hort.net/page13.html

http://extension.arizona.edu/sites/extension.arizona.edu/files/pubs/az1029.pdf




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